Dujiniai generatoriai veikia naudodami gamtines, biodujas arba suskystintas dujas (LPG). Jie išskiria mažiau teršalų ir veikia tyliau nei dyzeliniai. Tinka ilgalaikiam darbui gyvenamuosiuose kvartaluose, biuruose ar ekologiniuose ūkiuose. Dujiniai modeliai gali būti ekonomiškesni ten, kur dujų tiekimas yra nuolatinis. Dažnai naudojami kartu su CHP sistemomis (šilumos ir elektros gamyba). Užtikrina švaresnį energijos šaltinį be dyzelinio kuro kvapo ir išmetamųjų dalelių.